1994년 6월 1일 모체태아의학의 연구 발전을 도모하고 회원 상호간 및 국내외 학회간의 유대 및 교류를 통하여 우리나라의 임산부와 태아 관리를 향상시키기 위하여 김승욱 교수(서울의대)를 중심으로 26명의 산부인과 의사들이 참석한 가운데 발기인대회를 갖고 1994년 7월 1일 대한태아의학회 창립 총회 및 기념 심포지움을 서울대학교병원 소아병원 임상 제2강의실에서 개최함. 창립총회를 통해 김승욱 교수를 회장으로, 우복희 교수(이화의대)와 변지수 교수(전남의대)를 부회장으로, 김수평 교수(가톨릭의대)와 김종덕 교수(전북의대)를 감사로 선출하였으며 회칙을 제정, 심의함.
- 1995년
- 제 1차 대한태아의학회 학술대회 및 정기총회를 개최함.
- 1999년
- 대한태아의학회 학술대회에서 일반연제를 시작함.
- 2005년
- 대한태아의학회지 1권 1호를 발행함.
- 2009년
- 학회 명칭을 대한태아의학회에서 대한모체태아의학회로 변경함.
- 2010년
- 개원의 연수강좌 시작함.
- 2011년
- 한-대-일 심포지움 시작함.
- 2012년
- 산과 전공의/전임의 교육강좌 시작 및 모체태아의학회 연구회를 구성함.
- 대한모체태아의학회지 마지막으로 발행함. (현재는 Obstetrics and Gynecology Science로 통합됨)
- 2016년
- 대한의학회 가입.
- 2019년
- 학회 25주년 기념식 및 기념행사